More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  100 
 
 		 554 aa  1110    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  40.3 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  35.66 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  31.84 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  26.12 
 
 		 429 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  26.71 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  27.12 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  24.52 
 
 		 513 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.76 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  25.72 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.34 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  25.72 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.29 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  22.8 
 
 		 481 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  25.56 
 
 		 428 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  24.66 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25.3 
 
 		 436 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  24.41 
 
 		 433 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  25.97 
 
 		 451 aa  102  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  25.33 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  25.61 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  23.18 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  25.98 
 
 		 433 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  25.71 
 
 		 425 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  24.22 
 
 		 435 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.84 
 
 		 439 aa  97.1  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  25.21 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  26.61 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  23.92 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  94  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  24.23 
 
 		 463 aa  94  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  21.79 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  26.51 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  26.38 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  26.38 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  26.38 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  24.31 
 
 		 446 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  25.23 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  27.55 
 
 		 434 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.77 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25.56 
 
 		 442 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  25.79 
 
 		 471 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  24.07 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  25.24 
 
 		 433 aa  90.9  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  23.73 
 
 		 436 aa  90.5  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  26.15 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  23.43 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  24.5 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  24.76 
 
 		 427 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  24.5 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  24.65 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  23.44 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  22.61 
 
 		 488 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  24.81 
 
 		 425 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  24.14 
 
 		 427 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  24.79 
 
 		 434 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.12 
 
 		 427 aa  87  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  25.3 
 
 		 435 aa  87  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  23.61 
 
 		 466 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  24.79 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  25.14 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  24.79 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  21.97 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  25.43 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  24.95 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  24.79 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  24.36 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  22.75 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  22.94 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  25.7 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  27.14 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  26.57 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  23.06 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  25.33 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  24.09 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  25.21 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  23.98 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  22.27 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  22.54 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  23.98 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  23.98 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  26.04 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  25.3 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>