More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1203 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1203  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.856614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2450  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000016563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1875  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00450797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1827  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0283431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1738  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.485524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1623  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.47 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2193  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2202  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0636153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2279  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00696203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2412  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000515704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1791  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000231936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2005  response regulator receiver protein  39.04 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3920  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03557  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000983286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1840  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3685  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 231 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2494  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00298377  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1016  response regulator receiver domain-containing protein  37.05 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2518  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3982  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  32.92 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  34.19 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  33.76 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  33.2 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  32.77 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  32.77 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  33.61 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  33.05 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  32.78 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  30.96 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  32.92 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.24 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  31.47 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  31.47 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  31.47 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.47 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  31.47 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  31.47 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  31.47 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  30.13 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  31.3 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  29.79 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  31.6 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  32.48 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  32.31 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.06 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  31.88 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  28.45 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  31.88 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  31.88 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.84 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  27.95 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  32.7 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  30.74 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.13 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  30.7 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>