219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0869 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  80.75 
 
 		 442 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  885    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  53.47 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  50.25 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  45.56 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  46.6 
 
 		 447 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  32.88 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 		 432 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  31.59 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  32.15 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  32 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  32.08 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 		 464 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  29.47 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.58 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  29.05 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  29.57 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 404 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.38 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.71 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.14 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.17 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.71 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>