74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2116 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  817    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0375  hypothetical protein  41.45 
 
 		 443 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.271379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0317  outer membrane efflux protein  41.69 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  34.67 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  35.47 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0524  Outer membrane efflux protein  30.62 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.125027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2362  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.82 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.43 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.15 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.04 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.99 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1470 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.67 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.62 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  25.45 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.18 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.45 
 
 		 452 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.43 
 
 		 462 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 455 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.27 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.79 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.63 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.45 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.37 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.92 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.73 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.1 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1777  Outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.897239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.01 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.89 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.05 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.51 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 738 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  27.5 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  24.2 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.48 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.25 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.09 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.36 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.44 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.43 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.43 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  27.62 
 
 		 485 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.844775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>