More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3569 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  52.96 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 274 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  50.36 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  50.18 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  49.65 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  45.32 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.72 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  40.29 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.58 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 299 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  36.51 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  33.84 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  31.35 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  27.34 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 421 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 448 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 378 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 448 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 448 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  33.83 
 
 		 448 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  33.83 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 626 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 607 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  27.95 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  27.45 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.61 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.61 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.78 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.25 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  37.01 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.54 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.96 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.84 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>