More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1382 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1382  Patatin  100 
 
 		 330 aa  654    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  46.15 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  39.94 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  42.65 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  39.53 
 
 		 264 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  35.82 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  36.04 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  38.71 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  32.25 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.19 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  35.99 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  35.16 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.1 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.37 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  35.02 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.35 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  34.73 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.85 
 
 		 760 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.82 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  33.11 
 
 		 740 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.95 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  30.77 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.25 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  35.98 
 
 		 247 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.06 
 
 		 740 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  31.93 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  32.04 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.98 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.09 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  35.18 
 
 		 751 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.64 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.89 
 
 		 738 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.21 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.07 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.64 
 
 		 707 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  31.43 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  35.47 
 
 		 737 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.78 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  35.69 
 
 		 735 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.55 
 
 		 813 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.23 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  37.55 
 
 		 737 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  32.53 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.59 
 
 		 803 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.59 
 
 		 804 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.84 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.84 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  33.65 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  36.51 
 
 		 754 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.59 
 
 		 803 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.59 
 
 		 803 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  38.07 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.12 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.24 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.1 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  29.06 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  36.4 
 
 		 852 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  39.81 
 
 		 734 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  40 
 
 		 728 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.58 
 
 		 741 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.44 
 
 		 727 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  27.55 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.6 
 
 		 751 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  39.34 
 
 		 738 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  39.34 
 
 		 738 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  39.5 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.42 
 
 		 796 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.4 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.1 
 
 		 767 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.37 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  40.48 
 
 		 728 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  31.79 
 
 		 265 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  35.26 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  36.54 
 
 		 241 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  35.71 
 
 		 738 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.94 
 
 		 728 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.37 
 
 		 263 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.1 
 
 		 748 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.25 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  35.57 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.99 
 
 		 728 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.89 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  34.91 
 
 		 728 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  36.2 
 
 		 945 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  36.2 
 
 		 933 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  31.6 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.55 
 
 		 733 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  33.33 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.51 
 
 		 798 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  33.07 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  29.97 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  36.2 
 
 		 920 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  36.2 
 
 		 930 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  33.33 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.89 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  36.44 
 
 		 739 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.56 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.9 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.11 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>