More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0591 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.02 
 
 
206 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.88 
 
 
253 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  59.9 
 
 
211 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  59.9 
 
 
211 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.91 
 
 
208 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.34 
 
 
208 aa  237  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.65 
 
 
204 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.87 
 
 
218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.9 
 
 
210 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.94 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.73 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.98 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.38 
 
 
200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.05 
 
 
224 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.05 
 
 
224 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.56 
 
 
224 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57 
 
 
211 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.73 
 
 
238 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.2 
 
 
202 aa  205  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.01 
 
 
209 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.73 
 
 
207 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  49.5 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.51 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  52.09 
 
 
220 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.09 
 
 
220 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.69 
 
 
214 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.01 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.06 
 
 
206 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  51.16 
 
 
220 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.76 
 
 
220 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.27 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  48.02 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  46.27 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.27 
 
 
206 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.52 
 
 
231 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
212 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.19 
 
 
192 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
212 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 
208 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.53 
 
 
210 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
221 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.9 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
216 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.76 
 
 
206 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.2 
 
 
206 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.2 
 
 
206 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
207 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
212 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
339 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.21 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  36.92 
 
 
474 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.68 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  33.17 
 
 
229 aa  116  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 
212 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
216 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  36.63 
 
 
470 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.95 
 
 
576 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.98 
 
 
480 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.9 
 
 
209 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  36.87 
 
 
465 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  33.02 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.16 
 
 
478 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
263 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.09 
 
 
171 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.72 
 
 
246 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.38 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.06 
 
 
274 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.53 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.1 
 
 
235 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38 
 
 
457 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.24 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.59 
 
 
457 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.9 
 
 
469 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.92 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  31.66 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.3 
 
 
462 aa  84.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  32.63 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.11 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.02 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  37.5 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  29.17 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>