More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11910 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  75.28 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  75.28 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  76.38 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  54.31 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  45.26 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  40.33 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  38.19 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6077  oxidoreductase  32.18 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36.7 
 
 		 847 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  36.98 
 
 		 847 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.64 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 344 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.88 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 441 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.15 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 311 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 602 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 441 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 602 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.04 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 245 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>