More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10187 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  55.8 
 
 
730 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  100 
 
 
691 aa  1394    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  54.77 
 
 
731 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  48.86 
 
 
737 aa  592  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  48.37 
 
 
748 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  50.36 
 
 
748 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  48.64 
 
 
735 aa  554  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  46.35 
 
 
931 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  40.8 
 
 
731 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  40.97 
 
 
733 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  40.97 
 
 
733 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  41.19 
 
 
733 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  41.63 
 
 
733 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  41.63 
 
 
733 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  40.74 
 
 
733 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  40.44 
 
 
733 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  40.11 
 
 
731 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  40.2 
 
 
731 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  40.06 
 
 
922 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  42.86 
 
 
779 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  41.62 
 
 
751 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  41.74 
 
 
751 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  41.74 
 
 
751 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  42.26 
 
 
748 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 
755 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.32 
 
 
800 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  35.56 
 
 
762 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.98 
 
 
758 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.98 
 
 
749 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.02 
 
 
738 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.55 
 
 
734 aa  365  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.53 
 
 
755 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  34.46 
 
 
721 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 
745 aa  360  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  36.08 
 
 
701 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 
717 aa  359  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  33.75 
 
 
714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.92 
 
 
790 aa  353  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 
747 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.39 
 
 
1072 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  34.04 
 
 
722 aa  351  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 
711 aa  349  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  33.01 
 
 
814 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  34.11 
 
 
829 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.52 
 
 
746 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 
933 aa  346  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  35.74 
 
 
708 aa  344  2.9999999999999997e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.48 
 
 
757 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  40.14 
 
 
693 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.83 
 
 
987 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 
750 aa  334  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  36.71 
 
 
740 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.59 
 
 
757 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
721 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  32.62 
 
 
757 aa  332  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.7 
 
 
742 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.1 
 
 
809 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
813 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.98 
 
 
793 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35 
 
 
750 aa  327  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  32.87 
 
 
749 aa  327  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.83 
 
 
793 aa  326  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.53 
 
 
1158 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.87 
 
 
737 aa  321  3.9999999999999996e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 
760 aa  317  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 
685 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  32.15 
 
 
874 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 
748 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.78 
 
 
741 aa  306  6e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.76 
 
 
1321 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.8 
 
 
780 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
751 aa  299  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.74 
 
 
777 aa  297  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.39 
 
 
758 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.32 
 
 
1338 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 
737 aa  288  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.89 
 
 
716 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 
756 aa  283  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.99 
 
 
778 aa  279  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.99 
 
 
778 aa  278  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 
762 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 
724 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 
790 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.36 
 
 
772 aa  266  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 
783 aa  265  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.88 
 
 
737 aa  260  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.34 
 
 
782 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.49 
 
 
777 aa  257  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 
805 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  30.28 
 
 
905 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  29.62 
 
 
772 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  31.22 
 
 
802 aa  251  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.9 
 
 
771 aa  251  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.87 
 
 
760 aa  246  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.33 
 
 
868 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.32 
 
 
769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.95 
 
 
773 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  30.81 
 
 
819 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  28.97 
 
 
822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.87 
 
 
859 aa  240  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>