More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0481 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0481  protease  100 
 
 
371 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43704  normal  0.335547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.43 
 
 
394 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.95 
 
 
374 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  37.37 
 
 
344 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  32.61 
 
 
384 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  35.89 
 
 
365 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.22 
 
 
500 aa  99.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.22 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  38.54 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  38.25 
 
 
525 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  35.94 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  32.31 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  38.29 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  33.65 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 
297 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  33.18 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  38.82 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  33.65 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.48 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  38.29 
 
 
491 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.01 
 
 
537 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.1 
 
 
614 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.04 
 
 
674 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.89 
 
 
423 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  41.71 
 
 
514 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  36.5 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  38.42 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.4 
 
 
474 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  34.4 
 
 
474 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.6 
 
 
296 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.66 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.37 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  34.82 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  32.92 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.49 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  38.73 
 
 
483 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.35 
 
 
485 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40 
 
 
503 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.07 
 
 
512 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1229  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.8 
 
 
298 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0581563  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  36.15 
 
 
423 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.61 
 
 
480 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.25 
 
 
423 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  38.34 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.78 
 
 
338 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.82 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  29.41 
 
 
308 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  34.91 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  34.65 
 
 
510 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.31 
 
 
487 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.28 
 
 
404 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  37.95 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.02 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  37.95 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  38.3 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  41.24 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  41.24 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  40.45 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  37.07 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  38.55 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  40.41 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.57 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  40.24 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  40 
 
 
503 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  36.68 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  36.22 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  38.46 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  40.48 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  36.26 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.38 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.92 
 
 
569 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  38.04 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  38.59 
 
 
408 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  40 
 
 
505 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  33.97 
 
 
511 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.11 
 
 
426 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  38.92 
 
 
397 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.59 
 
 
408 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  38.92 
 
 
383 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.6 
 
 
368 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  37.28 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  34.48 
 
 
345 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.49 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  32.7 
 
 
444 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  39.66 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  35.75 
 
 
467 aa  86.3  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.89 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  35.08 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.98 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.71 
 
 
428 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  38.33 
 
 
411 aa  85.9  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  35.11 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  39.31 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.54 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  39.73 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.01 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>