More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1182 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  86.56 
 
 		 437 aa  736    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  87.5 
 
 		 437 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  85.48 
 
 		 466 aa  727    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  85.48 
 
 		 466 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  100 
 
 		 432 aa  846    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  85 
 
 		 466 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  87.97 
 
 		 437 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  87.03 
 
 		 437 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  73.13 
 
 		 445 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  66.02 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  59.47 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  56.39 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  56.9 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  55.96 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  55.96 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  50.82 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.2 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  53.11 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  54.69 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  53.66 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  52.73 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  52.73 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  52.73 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  52.97 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  52.73 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  52.84 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  52.73 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  52.73 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  52.73 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  50.84 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.26 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  55.48 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  54.93 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  54.93 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.59 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  51.54 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.66 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  51.54 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  51.54 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.91 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.67 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0268  ammonium transporter  48.58 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  51.74 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  50.57 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  51.67 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  52.07 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  50.68 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  54.29 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  55.5 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  55.5 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  52.98 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.67 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  51.07 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  54.14 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  49.52 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  53.35 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  50.84 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  49.19 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  54.61 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  54.61 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  50.85 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.91 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.91 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  49.19 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.12 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  52.9 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  56.44 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  49.19 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  50 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  52.12 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  49.76 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  52.12 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  49.4 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.7 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  52.12 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  48.71 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  52.04 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  49.28 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  48.85 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  48.85 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.77 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50.6 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32601  Amt family transporter: ammonium  51.7 
 
 		 530 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000576108  normal  0.0348473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  48.27 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  50.47 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  52.43 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  49.27 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  49.31 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  53.32 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  53.69 
 
 		 401 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  48.61 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  53.66 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  51.48 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  52.21 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  46.62 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.85 
 
 		 464 aa  356  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  48.28 
 
 		 405 aa  356  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  49.63 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  48.6 
 
 		 477 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  47.96 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>