More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2881 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  100 
 
 		 819 aa  1650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  41.09 
 
 		 338 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  38.7 
 
 		 338 aa  178  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  37.25 
 
 		 332 aa  164  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.42 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  28.2 
 
 		 686 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  25.5 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  31.1 
 
 		 353 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  27.73 
 
 		 435 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  28.25 
 
 		 441 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.36 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 666 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25.36 
 
 		 692 aa  100  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  25.84 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.85 
 
 		 432 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.08 
 
 		 568 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.77 
 
 		 459 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.6 
 
 		 470 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  29.26 
 
 		 484 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.26 
 
 		 407 aa  94.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.96 
 
 		 456 aa  94.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  29.04 
 
 		 702 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.08 
 
 		 433 aa  94  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.89 
 
 		 440 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.67 
 
 		 485 aa  91.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.11 
 
 		 672 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.34 
 
 		 433 aa  90.1  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.83 
 
 		 585 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.45 
 
 		 478 aa  88.2  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.07 
 
 		 1005 aa  88.6  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.86 
 
 		 444 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.14 
 
 		 423 aa  87  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  26.65 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.94 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  24.15 
 
 		 694 aa  85.5  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  28.22 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  24.77 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  24.52 
 
 		 441 aa  84  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.02 
 
 		 428 aa  84  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  35.12 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.76 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.05 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.56 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  23.08 
 
 		 415 aa  80.5  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.28 
 
 		 1014 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.45 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.81 
 
 		 1062 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.77 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.47 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.12 
 
 		 1138 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  24.94 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.22 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.25 
 
 		 438 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.12 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.34 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  22.52 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25.91 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  24.75 
 
 		 1052 aa  74.7  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.89 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  26.18 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  26.1 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.1 
 
 		 1084 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.66 
 
 		 1062 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.11 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  27.29 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.02 
 
 		 1062 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.09 
 
 		 433 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.66 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.66 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.99 
 
 		 1060 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.36 
 
 		 1081 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.57 
 
 		 412 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  23.56 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23 
 
 		 1111 aa  70.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.73 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.42 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.88 
 
 		 1066 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  24.26 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.73 
 
 		 1049 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.76 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.51 
 
 		 1062 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  26.24 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  26.84 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.96 
 
 		 1062 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  22.93 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  26.97 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.16 
 
 		 1067 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  25.54 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25 
 
 		 407 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  26.67 
 
 		 1078 aa  67  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  26.23 
 
 		 425 aa  67.4  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>