More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1151 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  100 
 
 		 299 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  55.33 
 
 		 301 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  51.37 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  46.04 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  46.6 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  41.32 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  38.28 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  44.72 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  48.6 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  46.8 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  42.12 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  35.27 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  37.63 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  43.14 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  39.81 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  38.83 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  37.67 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  35.76 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  41.49 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  33 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  40.46 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.26 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.26 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  34.59 
 
 		 764 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.23 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  32.02 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.9 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  33.23 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.45 
 
 		 325 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.37 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.29 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.62 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  32.25 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.22 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.42 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  31.86 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.74 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.21 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.58 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  31.87 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.38 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.31 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.91 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  36.98 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.73 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  33.45 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1270  ROK family protein  32.05 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253414  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.87 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.12 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  31.85 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.18 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.32 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.33 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  33.85 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.53 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.21 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  35.11 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  25.83 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.11 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  32.89 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  28.77 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  34.63 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.27 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.66 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.18 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  36 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.29 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.18 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.21 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.89 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  30.37 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  31.21 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  31.09 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  33.44 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.71 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.57 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.58 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  36.9 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.06 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  30.46 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.56 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4213  glucokinase  29.51 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.62 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.8 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.19 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  32.98 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  33.1 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1377  ROK family protein  30.54 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407084  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.23 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  30 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>