More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0481 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0481  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 372 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0581873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1254  lytic murein transglycosylase  60.38 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  56.35 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.01 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  35.01 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.49 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.76 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 430 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  32.23 
 
 		 347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  37.1 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 		 438 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.78 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  33.69 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  36.72 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.46 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.99 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  35.48 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.76 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  36.17 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  35.71 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  35.82 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  35.81 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 323 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  39.31 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  39.31 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  35.33 
 
 		 448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  34.64 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.24 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 		 421 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  31.49 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.82 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.17 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  31.09 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  40.57 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  33.42 
 
 		 445 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  33.71 
 
 		 432 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.85 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  36.01 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  33.12 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.44 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  33.43 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  29.86 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  32.05 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  33.61 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.83 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  34.28 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.6 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37.9 
 
 		 720 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  33.14 
 
 		 455 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 438 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  36.1 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  32.27 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  33.12 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  35.76 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  34.67 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  33.12 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0968  lytic murein transglycosylase  35.03 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.328766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  33.02 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  34.57 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.14 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.83 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  34.3 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  32.91 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  31.21 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  32.27 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  31.09 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  35.94 
 
 		 477 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>