More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  36.64 
 
 		 1015 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.66 
 
 		 1016 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  57.55 
 
 		 889 aa  1014    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 		 1016 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 1058 aa  667    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  39.49 
 
 		 1010 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.85 
 
 		 1066 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.56 
 
 		 1016 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 		 1020 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.64 
 
 		 1015 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.63 
 
 		 1015 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.96 
 
 		 1059 aa  759    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.89 
 
 		 1084 aa  1420    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  39.75 
 
 		 1010 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.67 
 
 		 1015 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  37 
 
 		 1014 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.66 
 
 		 1016 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.1 
 
 		 1023 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0824  formate dehydrogenase  59.37 
 
 		 864 aa  983    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.83 
 
 		 1096 aa  1275    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3728  formate dehydrogenase, alpha subunit  65 
 
 		 1063 aa  1420    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0214561  normal  0.0673651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3575  molybdopterin dinucleotide-binding region  58.53 
 
 		 883 aa  1057    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0862  molydopterin dinucleotide-binding region  58.7 
 
 		 861 aa  984    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1602  Formate dehydrogenase  66.74 
 
 		 956 aa  1248    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.11 
 
 		 1096 aa  1283    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.79 
 
 		 1015 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  37.66 
 
 		 1016 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5276  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.87 
 
 		 1095 aa  1385    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.76 
 
 		 1018 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 		 1010 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.7 
 
 		 1015 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04200  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  60.63 
 
 		 920 aa  1102    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0456011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 		 1022 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2291  formate dehydrogenase  54.05 
 
 		 870 aa  951    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0344  molybdopterin dinucleotide-binding region  64.24 
 
 		 905 aa  1171    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.76 
 
 		 1118 aa  1015    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.51 
 
 		 1013 aa  661    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5220  formate dehydrogenase  77.85 
 
 		 865 aa  1392    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  64.27 
 
 		 847 aa  1149    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.92 
 
 		 1010 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.97 
 
 		 1015 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5830  formate dehydrogenase  51.99 
 
 		 853 aa  874    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 1100 aa  2275    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 1028 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.02 
 
 		 1039 aa  1077    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.35 
 
 		 1023 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.06 
 
 		 1016 aa  646    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  36.63 
 
 		 1015 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.07 
 
 		 1050 aa  906    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  36.47 
 
 		 1026 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 1028 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.52 
 
 		 803 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.69 
 
 		 1011 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 		 1020 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.3 
 
 		 1015 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  35.87 
 
 		 1005 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.56 
 
 		 1016 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.88 
 
 		 1008 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 		 1009 aa  712    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5600  formate dehydrogenase  77.87 
 
 		 861 aa  1385    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.758687  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 1014 aa  667    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.44 
 
 		 1012 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5308  formate dehydrogenase  77.75 
 
 		 861 aa  1383    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418096  normal  0.849616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.91 
 
 		 1012 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.24 
 
 		 1003 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.73 
 
 		 1005 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2181  molydopterin dinucleotide-binding region  57.67 
 
 		 862 aa  976    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 		 1005 aa  676    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.16 
 
 		 1061 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 1016 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  39.27 
 
 		 808 aa  635  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  35.16 
 
 		 993 aa  632  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  35.46 
 
 		 993 aa  632  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 		 1023 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 1015 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 1004 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.89 
 
 		 1004 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  36.19 
 
 		 1016 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.7 
 
 		 1012 aa  625  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.87 
 
 		 993 aa  622  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 		 1015 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  36.02 
 
 		 1004 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.71 
 
 		 842 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.85 
 
 		 824 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  38.65 
 
 		 851 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.41 
 
 		 824 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 		 816 aa  588  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 		 802 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  38.11 
 
 		 820 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  37.47 
 
 		 811 aa  586  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.5 
 
 		 811 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.95 
 
 		 820 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  38.74 
 
 		 821 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  38.3 
 
 		 822 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.3 
 
 		 822 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.15 
 
 		 810 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.12 
 
 		 822 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.03 
 
 		 822 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.03 
 
 		 822 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>