More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3879 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  92.61 
 
 		 257 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  51.98 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  51.54 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  55.66 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  52.86 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  54.75 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.39 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  51.33 
 
 		 284 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  50.88 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  53.33 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  51.77 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  51.33 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.8 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  53.1 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  49.38 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.59 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.34 
 
 		 288 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  49.78 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  55.29 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  55.8 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  52.56 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.22 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.18 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.1 
 
 		 330 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  52.68 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.22 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.89 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52.23 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  48.65 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.12 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  52.68 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  51.8 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.32 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.11 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  48.78 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  52.53 
 
 		 284 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  52.53 
 
 		 284 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  46.36 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.23 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  52.8 
 
 		 244 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.16 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  48.02 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.16 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.43 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.53 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  46.09 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.66 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  47.76 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.88 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.46 
 
 		 284 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.94 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.22 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.35 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.78 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  53.52 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.34 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.69 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  49.77 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.35 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  49.15 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 440 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.43 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  49.34 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  50 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  43.27 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.16 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.78 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.4 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.77 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 276 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  47.81 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  48.02 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.3 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.48 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.11 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  51.16 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.49 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.03 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.02 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.53 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.12 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.91 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.71 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.78 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.4 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>