106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2369 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  53.51 
 
 		 332 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  55.36 
 
 		 974 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  55.66 
 
 		 815 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  52.83 
 
 		 988 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  45.05 
 
 		 950 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  43.24 
 
 		 969 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  43.31 
 
 		 412 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  50.47 
 
 		 969 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  48.11 
 
 		 1009 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  44.34 
 
 		 874 aa  85.5  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  35.92 
 
 		 995 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  35.92 
 
 		 995 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  33.03 
 
 		 1059 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  33.04 
 
 		 988 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  33.04 
 
 		 988 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  33.04 
 
 		 988 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  30.91 
 
 		 993 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  30.91 
 
 		 993 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  32.38 
 
 		 999 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  32.38 
 
 		 999 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  32.38 
 
 		 999 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  32.38 
 
 		 999 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  28.7 
 
 		 989 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  30.39 
 
 		 1013 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  30.63 
 
 		 989 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  28 
 
 		 1007 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 		 988 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  28 
 
 		 1007 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.7 
 
 		 988 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  30.7 
 
 		 606 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 996 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 996 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 996 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 		 988 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  30.7 
 
 		 988 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  30.7 
 
 		 988 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  30.7 
 
 		 988 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 		 988 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 		 964 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  30.7 
 
 		 988 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  30.7 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  30.7 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.14 
 
 		 988 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.14 
 
 		 988 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  32.17 
 
 		 988 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  30.7 
 
 		 988 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 988 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 988 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  28.71 
 
 		 1012 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  26.79 
 
 		 1028 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 		 996 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  30.7 
 
 		 988 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  25.23 
 
 		 977 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  27.72 
 
 		 990 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  28.44 
 
 		 990 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 		 988 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  29.25 
 
 		 988 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  29.32 
 
 		 997 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.77 
 
 		 986 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  26.36 
 
 		 994 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  26.28 
 
 		 985 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  25.69 
 
 		 989 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 		 976 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  27.52 
 
 		 990 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 		 924 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  27.52 
 
 		 990 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 1006 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 1006 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  27.52 
 
 		 989 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 1015 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 990 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 990 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 990 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 990 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.77 
 
 		 992 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.77 
 
 		 992 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.61 
 
 		 755 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 990 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  31.25 
 
 		 970 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.19 
 
 		 1029 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  25.69 
 
 		 1004 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 		 994 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 		 550 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 		 994 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 		 862 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.76 
 
 		 772 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  29.92 
 
 		 766 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>