287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1166 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1368  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.13 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.82 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.97 
 
 
165 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.19 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 
168 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  40 
 
 
179 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  34.74 
 
 
195 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  29.61 
 
 
372 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.13 
 
 
193 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.61 
 
 
387 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.36 
 
 
197 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.09 
 
 
206 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 
184 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  31.98 
 
 
215 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  33.9 
 
 
199 aa  101  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  29.82 
 
 
206 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  31.18 
 
 
387 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 
274 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.93 
 
 
269 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.09 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  30.48 
 
 
282 aa  98.2  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 
245 aa  98.2  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  32.8 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  32.39 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.12 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  31.79 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.93 
 
 
534 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.34 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 
352 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  31.61 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.47 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
250 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  30.37 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.71 
 
 
192 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  33.14 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  33.14 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  33.14 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  28.74 
 
 
239 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  28.31 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  33.8 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  33.13 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  38.64 
 
 
318 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  32.12 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.71 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
254 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  30.12 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  33.53 
 
 
385 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  31.74 
 
 
183 aa  91.7  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  31.1 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  28.8 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  31.71 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  32.74 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  31.52 
 
 
349 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  31.71 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  30.73 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  32.14 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  28.4 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  32.94 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  27.68 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  30.95 
 
 
184 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  26.46 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.95 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  32.92 
 
 
171 aa  89  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  29.41 
 
 
234 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.12 
 
 
299 aa  88.6  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  29.89 
 
 
261 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 
256 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.82 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  32.61 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
358 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.19 
 
 
174 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  31.25 
 
 
311 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.33 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  35.15 
 
 
432 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.94 
 
 
389 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 
340 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 
340 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 
345 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
206 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>