110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0931 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0931  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
311 aa  584  1e-166  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  40.6 
 
 
307 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1540  sodium/calcium exchanger membrane region  38.39 
 
 
305 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.494574  normal  0.0390081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0303  hypothetical protein  27.31 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.667195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  27.57 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  26.28 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.09 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  25.54 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.89 
 
 
367 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  25.56 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.48 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.84 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  27.46 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  25.4 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  22.37 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.49 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.24 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.19 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.78 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  23.39 
 
 
335 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.47 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  27.41 
 
 
323 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  22.27 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  25.66 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.08 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.19 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.16 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  23.87 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  24.42 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  25.08 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.88 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  22.75 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.53 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  23.69 
 
 
406 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.7 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.38 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  23.17 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.57 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.66 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.83 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  23.76 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.94 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.94 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.94 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.78 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.74 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  24.75 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  24.75 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  25.08 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.8 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.7 
 
 
358 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.35 
 
 
314 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 
320 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.35 
 
 
314 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  22.39 
 
 
335 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.04 
 
 
320 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.18 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.12 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  27.06 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  23.63 
 
 
330 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.98 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1591  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.29 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0780094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.09 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.32 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  24.85 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.48 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  22.96 
 
 
348 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.35 
 
 
314 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0308  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  20.11 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.64 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  22.15 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.59 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.21 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.21 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  22.15 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.21 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  31.08 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.71 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.71 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  22.15 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1218  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.31 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.03 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  24.21 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0608  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  32.79 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.77 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  22.19 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  35.53 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.84 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  23.81 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.76 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  22.44 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.29 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.32 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  30.43 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>