More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6954 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6799  transcriptional regulator, LysR family  66.33 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2476  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3625  transcriptional regulator, LysR family  50.33 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  36.45 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3644  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  36.18 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5933  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.67 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  33.17 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.5 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  36.32 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0443  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4429  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1324  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  28.37 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.9 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1798  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103195  normal  0.329714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  26.61 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  26.41 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  32.42 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004316  transcriptional regulator LysR family  32.37 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.610995  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  32.34 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>