More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6773 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  84.19 
 
 		 217 aa  357  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.53 
 
 		 217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.63 
 
 		 218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  72.09 
 
 		 217 aa  307  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.02 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  68.08 
 
 		 214 aa  284  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.26 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.51 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.12 
 
 		 218 aa  278  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  65.58 
 
 		 218 aa  277  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  64.65 
 
 		 219 aa  275  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.79 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  61.86 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  62.33 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.14 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  63.26 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.79 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  61.4 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  63.72 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.33 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.67 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.4 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.74 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.81 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.35 
 
 		 226 aa  227  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.86 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.53 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  59.53 
 
 		 231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.07 
 
 		 227 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.6 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.67 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  58.14 
 
 		 243 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.6 
 
 		 222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.54 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.88 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.84 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  48.17 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.12 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  51.16 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 228 aa  167  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 283 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.54 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  49.3 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  44.5 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  44.29 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  44.04 
 
 		 253 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.87 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.75 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.58 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.95 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.7 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>