More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5479 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  56.03 
 
 
284 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  63.6 
 
 
308 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  57.58 
 
 
273 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  57.58 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  57.2 
 
 
273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  57.2 
 
 
273 aa  334  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  57.2 
 
 
273 aa  334  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  57.2 
 
 
273 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  57.2 
 
 
273 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  56.44 
 
 
273 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  62.59 
 
 
345 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  59.57 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  59.25 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  61.69 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  59.77 
 
 
286 aa  298  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  56.72 
 
 
290 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  56.7 
 
 
264 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  55.02 
 
 
280 aa  278  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  53.82 
 
 
298 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  53.77 
 
 
296 aa  255  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  47.94 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  46.39 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  58.14 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  63.79 
 
 
60 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  54.65 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.84 
 
 
416 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  60.94 
 
 
172 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  51.02 
 
 
900 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  45.37 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  57.14 
 
 
903 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  60.29 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  60.29 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  47 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  60 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 
433 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  51.76 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  52.27 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  62.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  43.94 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  51.09 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  62.71 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  62.71 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  48.81 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  39.22 
 
 
103 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  67.86 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
447 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  48.84 
 
 
745 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  46.51 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  38.28 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  46.51 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  36.88 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
163 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  51.47 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  43.04 
 
 
315 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  39.45 
 
 
204 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  51.22 
 
 
143 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  50.7 
 
 
168 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  60 
 
 
156 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  63.79 
 
 
1033 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  57.35 
 
 
179 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  57.38 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 
973 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  43.04 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  51.43 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  35.51 
 
 
389 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  61.4 
 
 
147 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  42.06 
 
 
115 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  45.83 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  37.78 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.83 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.96 
 
 
194 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.38 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  50.68 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  68.75 
 
 
222 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  45.65 
 
 
517 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  46.05 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  70.21 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  55.93 
 
 
146 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  46.05 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  48.1 
 
 
152 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 
241 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  49.3 
 
 
151 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  44.44 
 
 
381 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  46.32 
 
 
1831 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  50.79 
 
 
824 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 
442 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  45.36 
 
 
870 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.38 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.24 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 
497 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>