More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5263 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  85.2 
 
 
223 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  77.13 
 
 
223 aa  348  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  59.26 
 
 
220 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.65 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.6 
 
 
225 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.74 
 
 
225 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
236 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.7 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
236 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 
268 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
238 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.79 
 
 
238 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  30 
 
 
244 aa  99  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
266 aa  95.1  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
248 aa  92.8  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.02 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  27.93 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.89 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.69 
 
 
695 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  26.17 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  31.41 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.17 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.17 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  25.7 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  25.7 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.17 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  23.91 
 
 
719 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  28.25 
 
 
275 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.77 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  27.8 
 
 
275 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  28.36 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.94 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  29.35 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.65 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  31.06 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.77 
 
 
265 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  31.38 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.21 
 
 
716 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214886  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.65 
 
 
716 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
261 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  30.11 
 
 
716 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.21 
 
 
716 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.9 
 
 
721 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000436351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  25.73 
 
 
257 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
267 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.65 
 
 
716 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000142726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
288 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.21 
 
 
716 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  0.0928746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.09 
 
 
716 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000356561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  27.5 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.09 
 
 
716 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000906563  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.03 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.21 
 
 
716 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0281216  hitchhiker  0.000170184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0024  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.65 
 
 
716 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00830663  hitchhiker  0.0000000474346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  25 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  23.33 
 
 
719 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  26.63 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.46 
 
 
729 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  23.33 
 
 
719 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  28.72 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  25.4 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.72 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  30.09 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.95 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  26.34 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  28.16 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.53 
 
 
717 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.06 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.42 
 
 
716 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27 
 
 
258 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25 
 
 
729 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25 
 
 
729 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.22 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25 
 
 
729 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  24.88 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  25.84 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  25.24 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.02 
 
 
276 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>