78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5018 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  35.91 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  34.05 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  38.4 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  33.52 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  36.46 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  28.09 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.05 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  28.93 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  30.86 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  30.86 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  30.86 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  43.06 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  28.82 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  49.15 
 
 
192 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.26 
 
 
189 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  40.22 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  32.41 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  24.38 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  54.55 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  27.81 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  34.94 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  28.02 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  34.26 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  32.32 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  33.66 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  42.65 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  31.16 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  29.34 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  31.06 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  25.37 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  51.06 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  33.09 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.54 
 
 
175 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  37.31 
 
 
226 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  29.19 
 
 
183 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  53.49 
 
 
174 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  41.18 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  34.15 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  41.27 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  31.71 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  27.98 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  43.48 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  28.49 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  29.32 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  28.49 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  48.89 
 
 
192 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  43.75 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  27.94 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  23.28 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  23.4 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  28.19 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  43.18 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  33.75 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  33.75 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  31.87 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  24.34 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  24.34 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  24.34 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  24.34 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  33.75 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  39.44 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  48.78 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  43.9 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>