More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3591 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3591  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1145    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0726978  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  40.44 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 623 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  39.48 
 
 		 589 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 594 aa  352  8.999999999999999e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  38.73 
 
 		 635 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.21 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.65 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.24 
 
 		 613 aa  323  5e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 622 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  37.58 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.4 
 
 		 627 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  35.25 
 
 		 636 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 642 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.17 
 
 		 634 aa  300  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  33.77 
 
 		 642 aa  296  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  33.67 
 
 		 658 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 632 aa  293  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 640 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.73 
 
 		 622 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  33.66 
 
 		 648 aa  291  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 624 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  33.44 
 
 		 658 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  33 
 
 		 638 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  30.36 
 
 		 611 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 628 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  31.98 
 
 		 687 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.13 
 
 		 671 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  33.39 
 
 		 637 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  34.49 
 
 		 620 aa  274  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.72 
 
 		 614 aa  273  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  33.17 
 
 		 637 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  33.28 
 
 		 659 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  33.33 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.6 
 
 		 597 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 635 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 622 aa  270  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.73 
 
 		 654 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  31.48 
 
 		 641 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.11 
 
 		 627 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  33.11 
 
 		 627 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 624 aa  267  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  32.74 
 
 		 638 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  33.6 
 
 		 639 aa  266  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  31.9 
 
 		 626 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  32.77 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.72 
 
 		 627 aa  263  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.85 
 
 		 641 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.76 
 
 		 640 aa  263  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.03 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  33.71 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.21 
 
 		 627 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.45 
 
 		 631 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  33.83 
 
 		 648 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 		 619 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  32.57 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.57 
 
 		 634 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  31.48 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  29.67 
 
 		 648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.78 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  34.88 
 
 		 638 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.13 
 
 		 619 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.85 
 
 		 652 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.12 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.3 
 
 		 601 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  32.55 
 
 		 649 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  34.65 
 
 		 672 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.88 
 
 		 600 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.16 
 
 		 666 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.36 
 
 		 628 aa  246  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.11 
 
 		 629 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  30.44 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 581 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 		 586 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.26 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  33.28 
 
 		 627 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.94 
 
 		 617 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.99 
 
 		 586 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.73 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.92 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.92 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.11 
 
 		 616 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 663 aa  240  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  31.52 
 
 		 601 aa  240  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  32.28 
 
 		 672 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.66 
 
 		 602 aa  240  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 764 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  31.67 
 
 		 669 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.82 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.82 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.82 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  31.94 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.18 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.45 
 
 		 616 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>