120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2339 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  43.67 
 
 
333 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 
321 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  35.59 
 
 
302 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  34.55 
 
 
353 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 
295 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  38.08 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.63 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  32.72 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  31.44 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  30.43 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  28.62 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.3 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.74 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.89 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.5 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.91 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.55 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  28.48 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.35 
 
 
294 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  25.35 
 
 
294 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  23.19 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  25.09 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  28.95 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.35 
 
 
316 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.04 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.78 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  21.84 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.75 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.29 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.75 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  27.11 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  24.28 
 
 
296 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.8 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  24.4 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  27.42 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  21.33 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  27.27 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25.17 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  29.37 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  25.18 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  32.1 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  26.04 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  28.09 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  29.51 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  30.17 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.12 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  26.38 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  24.31 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  31.37 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.3 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
312 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.95 
 
 
273 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  24.6 
 
 
286 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.74 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  23.94 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.74 
 
 
309 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.24 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.33 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.31 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>