More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1933 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  453  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  57.4 
 
 
229 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  56.62 
 
 
235 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  56.05 
 
 
237 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  54.88 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  56.11 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
229 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  53.95 
 
 
229 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.5 
 
 
259 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.23 
 
 
265 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  42.01 
 
 
223 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  53.15 
 
 
232 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
250 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
223 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  39.55 
 
 
235 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44.7 
 
 
654 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  43.58 
 
 
228 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  43.81 
 
 
246 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  39.37 
 
 
225 aa  168  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
226 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.91 
 
 
223 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  42.86 
 
 
650 aa  168  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  44.95 
 
 
648 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
246 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  44.84 
 
 
280 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.09 
 
 
230 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
222 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
218 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
240 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.55 
 
 
277 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  41.07 
 
 
241 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.95 
 
 
244 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  43.58 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
240 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  47.78 
 
 
247 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  43.39 
 
 
245 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  39.74 
 
 
249 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40 
 
 
233 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  40 
 
 
238 aa  165  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  45.21 
 
 
654 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  44.24 
 
 
655 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.29 
 
 
224 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  41.67 
 
 
221 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.66 
 
 
241 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  40.34 
 
 
656 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.19 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.22 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  40.36 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  37.67 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  35.09 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  39.55 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.94 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  41.55 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
248 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  38.6 
 
 
221 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40.18 
 
 
239 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 
223 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
227 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  39.55 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  40.91 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  37.33 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  41.07 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.3 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  39.35 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  42.67 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40 
 
 
234 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  39.62 
 
 
236 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1518  ABC transporter related  46.76 
 
 
222 aa  161  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 
646 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.18 
 
 
232 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.55 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
229 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.05 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.55 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  41.1 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  38.89 
 
 
230 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  48.96 
 
 
276 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
225 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  40.08 
 
 
653 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5622  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
239 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630537  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  43.59 
 
 
654 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  48.62 
 
 
230 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
236 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 
233 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  41.55 
 
 
234 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.12 
 
 
233 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>