More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1119 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 176 aa  346  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  83.46 
 
 		 190 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  80 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  61.88 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  66.67 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  60.32 
 
 		 197 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  79.34 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 229 aa  193  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  79.34 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  62.57 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  67.81 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  60.71 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  59.88 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  73.33 
 
 		 268 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  66.67 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  75.42 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  59.88 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  66.92 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  60.93 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 195 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 195 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 195 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  50.99 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  65.41 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  66.12 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  68.91 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  51.76 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  68.64 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  53.89 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  68.64 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  53.04 
 
 		 242 aa  165  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  59.76 
 
 		 206 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  60.99 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  67.77 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  65.96 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  49.13 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  44.02 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  43.68 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 114 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 208 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  45.71 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  51.75 
 
 		 118 aa  124  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  60.19 
 
 		 117 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 140 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 112 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  50.85 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  36.5 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 128 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  49.57 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  42.03 
 
 		 140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  56.7 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 124 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  41.3 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.75 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  47.79 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  43.8 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  47.79 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 126 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 126 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 132 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 132 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  46.15 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  41.1 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  45.54 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  45.06 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  43.36 
 
 		 140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>