More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0196 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  213  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  58.49 
 
 		 445 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  58.49 
 
 		 445 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3417  hypothetical protein  54 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.548763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  51.79 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  44.74 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  46.81 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  52.94 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  45.1 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.58 
 
 		 302 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  47.92 
 
 		 379 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  39.66 
 
 		 304 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  43.86 
 
 		 426 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  45.61 
 
 		 282 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  65.71 
 
 		 330 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  65.71 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  50 
 
 		 298 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  46.94 
 
 		 291 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  48.08 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  52.38 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  43.64 
 
 		 316 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  44.62 
 
 		 329 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  39.02 
 
 		 320 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  42.86 
 
 		 332 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  44.44 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  48.84 
 
 		 295 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  44 
 
 		 307 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  34.38 
 
 		 328 aa  48.9  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  47.83 
 
 		 336 aa  48.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  50 
 
 		 298 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  45.65 
 
 		 371 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 332 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  32.56 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  41.79 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  53.66 
 
 		 304 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  48.84 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.62 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  63.64 
 
 		 373 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  35.71 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.48 
 
 		 302 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  40.85 
 
 		 302 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  53.85 
 
 		 313 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  50 
 
 		 333 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  36.84 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.22 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 		 305 aa  47  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  46.81 
 
 		 308 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  46.51 
 
 		 303 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.83 
 
 		 330 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.22 
 
 		 300 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  41.43 
 
 		 462 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  53.49 
 
 		 312 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  45.45 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  35.63 
 
 		 318 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  51.22 
 
 		 299 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.78 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  46.51 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  40.32 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  47.27 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  43.18 
 
 		 309 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  47.73 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.78 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.24 
 
 		 355 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  55.56 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  38.57 
 
 		 308 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  40.32 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.78 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  52.78 
 
 		 472 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  40.91 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  48.78 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  51.35 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.51 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>