More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3610 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  87.34 
 
 		 380 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  94.69 
 
 		 378 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  96.82 
 
 		 377 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 377 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  85.45 
 
 		 378 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  85.22 
 
 		 379 aa  666    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  96.55 
 
 		 377 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  86.32 
 
 		 380 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  87.07 
 
 		 380 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  94.96 
 
 		 377 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  94.69 
 
 		 377 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  84.66 
 
 		 380 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  96.82 
 
 		 377 aa  754    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  96.82 
 
 		 377 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  95.23 
 
 		 377 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  82.76 
 
 		 376 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  73.85 
 
 		 382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  73.85 
 
 		 373 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  73.91 
 
 		 369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  72.16 
 
 		 373 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  73.1 
 
 		 373 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  72.83 
 
 		 372 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  70.73 
 
 		 393 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  70 
 
 		 393 aa  544  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  69.89 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  68.11 
 
 		 391 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  65.87 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  65.49 
 
 		 377 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  65.7 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  56.13 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  56.47 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  51.47 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  52.39 
 
 		 396 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  52.39 
 
 		 396 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  51.92 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  52.13 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  51.87 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  49.6 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  52.11 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  51.69 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.35 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  51.63 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.88 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  55.85 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  44.74 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.53 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  47.53 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  48.6 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  48.35 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  46.22 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  43.94 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  46.22 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  43.01 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  45.6 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  47.65 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  44.17 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  48 
 
 		 389 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  42.11 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  35.4 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  34.97 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  35.64 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  35.14 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.79 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 426 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  38.8 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  35.37 
 
 		 413 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  35.4 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  34.53 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  35.32 
 
 		 455 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  35.4 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  34.69 
 
 		 414 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.39 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  35.4 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.28 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.06 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.28 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.07 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  33.68 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.44 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.29 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  35.91 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  36.09 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  33.52 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  35.28 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.05 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.6 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.6 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.13 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  33.61 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  34.88 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.88 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>