60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0793 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  78.48 
 
 		 318 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  79.11 
 
 		 318 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  78.8 
 
 		 318 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  78.16 
 
 		 318 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  75 
 
 		 318 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  75 
 
 		 318 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  74.68 
 
 		 318 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  75 
 
 		 318 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  47.02 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  47.59 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  46.6 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  46.23 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  46.25 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  42.07 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  34.42 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  33.99 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  28.97 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  30.79 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.36 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  26.87 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  28.73 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.89 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  24.12 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  25.45 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  25.5 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  30.09 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  25.69 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  23.3 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.66 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  26.52 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  23.29 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.44 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  30.2 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  28.92 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  33.77 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  22.06 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  26.71 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  26.29 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  24.21 
 
 		 417 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  24.31 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  24.89 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94419  predicted protein  23.61 
 
 		 2525 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  21.93 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2390  hypothetical protein  34.67 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.375551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  25.53 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  23.21 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  22.13 
 
 		 600 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  26.14 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  24.06 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  23.16 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  23.86 
 
 		 456 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.06 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  30.93 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>