130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2544 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  77.71 
 
 		 351 aa  584  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  77.43 
 
 		 351 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  75.14 
 
 		 351 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  66.19 
 
 		 352 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  64.29 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  62.86 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.43 
 
 		 350 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.14 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.86 
 
 		 351 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  63.43 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  66.07 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  63.14 
 
 		 352 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  63.43 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  61.71 
 
 		 350 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  64 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  62.11 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.96 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  61.43 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  64 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  60.86 
 
 		 350 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  61.96 
 
 		 351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  62.86 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  63.25 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  62.86 
 
 		 349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.57 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.86 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  62 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  61.43 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  61.71 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  60.74 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  63.25 
 
 		 351 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  63.4 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  64.78 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  62 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.14 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.25 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.86 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  60 
 
 		 354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.4 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  60.51 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.11 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  58.24 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.45 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  32.27 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  32.78 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.56 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.89 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.86 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.09 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.75 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  30.35 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  29.71 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  31.13 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  31.76 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  31.53 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.09 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.52 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.09 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  28.48 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  23.71 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.34 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  24.04 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.89 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  24.06 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.34 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.9 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.49 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  22.26 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.9 
 
 		 322 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.75 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.07 
 
 		 306 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  22.67 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  31.78 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.21 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.6 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  27.11 
 
 		 294 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  29.58 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.42 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.35 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.99 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  26.6 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  26.6 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>