More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2353 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  100 
 
 		 529 aa  1044    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  61.37 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  64.3 
 
 		 574 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  61.37 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  61.37 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  61.37 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  62.23 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  61.02 
 
 		 512 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  65.11 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  61.43 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  63.24 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  63.71 
 
 		 521 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  58.72 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  57.56 
 
 		 522 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 		 522 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.51 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 587 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  31.47 
 
 		 582 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.33 
 
 		 519 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 511 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 514 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 480 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 502 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 521 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 519 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 		 583 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.49 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 478 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 		 468 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.12 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.35 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.6 
 
 		 467 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 520 aa  172  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 534 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  30.66 
 
 		 537 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.03 
 
 		 457 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  30.38 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.1 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.4 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 500 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 487 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>