235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2848 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2848  LemA family protein  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  36.25 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  35.98 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  34.07 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  39.49 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  33.55 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  33.55 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  32.9 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  35.58 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  35.09 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  34.48 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  32.7 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  32.5 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  35.9 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  32.08 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  32.65 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  32.89 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  32.68 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  35.54 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  29.67 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  35.42 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  32.08 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  28.41 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  30.54 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  30.82 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  34.51 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  29.19 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  28.92 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  28.92 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  28.92 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  31.71 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  32.14 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  32.26 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  29.94 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  32.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  29.94 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  29.94 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  31.41 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  31.1 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  27.86 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  31.1 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  33.14 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  33.75 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  31.25 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf801  conserved hypothetical membrane protein LemA  34.39 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  29.52 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  25.47 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  32.48 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  33.78 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  33.97 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  33.97 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  28.76 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  33.1 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  32.92 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  29.79 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  32.41 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  29.41 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  31.94 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  31.71 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  27.42 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  30.72 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  29.17 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  28.28 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  30.82 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  29.79 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  27.67 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  34.48 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  29.27 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  29.94 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  34.03 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  32.32 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  30 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.41 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  28.06 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  27.89 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  28.86 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  30.95 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  28.49 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  28.75 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  27.53 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.19 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  30 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  30.11 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  27.51 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  29.17 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  32.1 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  27.38 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  29.34 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  30.71 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  30.06 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  27.97 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  28.49 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  29.94 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  29.61 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>