66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2605 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1116    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  55.9 
 
 		 548 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  55.03 
 
 		 564 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  54.03 
 
 		 544 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  55.38 
 
 		 564 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  53.5 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  54.2 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  53.67 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  54.32 
 
 		 564 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  56.13 
 
 		 555 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  53.8 
 
 		 547 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  53.06 
 
 		 552 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  52.73 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  52.36 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  45.74 
 
 		 586 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  44.71 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  35.7 
 
 		 584 aa  326  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  40.83 
 
 		 581 aa  326  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  41.24 
 
 		 586 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  31.77 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28.47 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  29.98 
 
 		 543 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  29.79 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  29.73 
 
 		 544 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.41 
 
 		 543 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  29.86 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  27.58 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  28.42 
 
 		 546 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  28.49 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.38 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.95 
 
 		 541 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  28.05 
 
 		 550 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  31.18 
 
 		 580 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.48 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.37 
 
 		 548 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  28.63 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  28.21 
 
 		 595 aa  171  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  26.37 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.61 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  24.53 
 
 		 570 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  28.27 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  26.7 
 
 		 585 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  28.77 
 
 		 611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  27.11 
 
 		 589 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  24.68 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  24.03 
 
 		 572 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.1 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  25.3 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  21.43 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  21.63 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  31.4 
 
 		 438 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  20.78 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  24.61 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  28.33 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  23.19 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  27.64 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  22.47 
 
 		 363 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  23.82 
 
 		 584 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  21.04 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.9 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  24.23 
 
 		 659 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  25.38 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  25.23 
 
 		 871 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  24.15 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  21.74 
 
 		 601 aa  43.9  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>