65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5749 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  45.9 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  37.43 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  25.4 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  30.29 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  32.16 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0896  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  28.3 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  33.7 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  30.22 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.16 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.16 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.16 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  31.62 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  30.81 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  30.43 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 227 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 202 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 193 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 213 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  29.3 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 263 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2820  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310679  normal  0.463394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>