84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0933 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  284  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
145 aa  48.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  32.58 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
223 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
171 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  32.8 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  36.08 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.29 
 
 
292 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  35.53 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
158 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  30.26 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
140 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
149 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
163 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
134 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  38.71 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
151 aa  40.8  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.67 
 
 
291 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
151 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>