174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0912 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0912  integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  708    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  81.3 
 
 		 353 aa  586  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  35.26 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  30.4 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  30.99 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.5 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  21.92 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.69 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.15 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  21.87 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  26.79 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.42 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  28.12 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.85 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.61 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  24.17 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 538 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  24.55 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  25.5 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.29 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 568 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  24.28 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.82 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.58 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.93 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.32 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.93 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  26.42 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.91 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.53 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.91 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  23.23 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  31.48 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.31 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  23.73 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  20.56 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.29 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.02 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  23.84 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.29 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.12 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.12 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  23.01 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  20 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  22.85 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27.11 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  23.08 
 
 		 564 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.11 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  24.01 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  26.67 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  20.81 
 
 		 431 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  22.47 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.4 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  20.98 
 
 		 327 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  18.81 
 
 		 317 aa  46.2  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.44 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  22.78 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.7 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  23.04 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  23.93 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  22.33 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.9 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.03 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.53 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.84 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.12 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  25.17 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  27.34 
 
 		 204 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>