More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0831 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  60.44 
 
 
226 aa  255  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  46.82 
 
 
224 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 
233 aa  204  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  46.61 
 
 
223 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  48.8 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
275 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
224 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 
226 aa  197  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  48.06 
 
 
227 aa  197  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
235 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.54 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 
234 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 
227 aa  194  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 
235 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  47.09 
 
 
227 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  192  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
234 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 
232 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 
227 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.53 
 
 
233 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
234 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 
232 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  50.5 
 
 
224 aa  192  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 
232 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
222 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  46.79 
 
 
217 aa  192  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.11 
 
 
232 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.19 
 
 
223 aa  191  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.05 
 
 
234 aa  191  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.05 
 
 
234 aa  191  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 
235 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
234 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.67 
 
 
232 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 
231 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  45.77 
 
 
227 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  47.03 
 
 
238 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.86 
 
 
227 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  43.64 
 
 
235 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
246 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  43.24 
 
 
227 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
228 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  44.09 
 
 
271 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47 
 
 
226 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  46.02 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.36 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  44.34 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  46.12 
 
 
227 aa  188  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  42.79 
 
 
232 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  43.44 
 
 
226 aa  188  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  188  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  42.79 
 
 
227 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 
227 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 
235 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  42.53 
 
 
246 aa  188  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  45.81 
 
 
238 aa  188  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 
242 aa  188  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.44 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  46.53 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
236 aa  187  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.64 
 
 
235 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  43.33 
 
 
241 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.51 
 
 
227 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  45.05 
 
 
240 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.08 
 
 
230 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  42.01 
 
 
254 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  45.5 
 
 
220 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  41.36 
 
 
230 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
246 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  43.44 
 
 
248 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
255 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
240 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 
231 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  40.72 
 
 
245 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.26 
 
 
225 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  43.24 
 
 
232 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
220 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.53 
 
 
230 aa  184  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  42.2 
 
 
221 aa  184  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>