211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2527 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  66.9 
 
 		 307 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  68.21 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  64.98 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  59.34 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  59.34 
 
 		 286 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  59.34 
 
 		 286 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  56.18 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  48.9 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  47.42 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  48.5 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  43.96 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  45.49 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  44.84 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  45.71 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  45 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  45.55 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  43.84 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  44.93 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  46.04 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  43.17 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  42.55 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  43.16 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  43.16 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  40.53 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  28.26 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  28.17 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.29 
 
 		 392 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.57 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.66 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.17 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.19 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.81 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.81 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.81 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 355 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.78 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31.11 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  26.45 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  29.02 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.17 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.37 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.17 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.78 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.84 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.35 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.32 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.59 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.9 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.45 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.55 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  27.76 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  25.39 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.77 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.9 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.98 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  32.02 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.05 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  24.03 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.05 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.05 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  22.3 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  23.67 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  20.95 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  28.91 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  28.91 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  23.57 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.71 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  28.99 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>