More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5431 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  66.49 
 
 		 194 aa  264  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  57.67 
 
 		 184 aa  233  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  56.84 
 
 		 196 aa  224  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  57.67 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  57.37 
 
 		 186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  51.32 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1904  peptide deformylase  51.55 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  52.94 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  46.84 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  46.35 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  43.55 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  49.17 
 
 		 178 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.96 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  43.48 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  42.33 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  41.49 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  43.62 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  42.02 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  41.67 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  43.48 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  42.22 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  42.08 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  41.24 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  44.83 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  44.25 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.24 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  42.05 
 
 		 174 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.42 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  41.76 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.42 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.61 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  42.13 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  43.18 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.45 
 
 		 174 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.89 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  41.9 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  43.18 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.34 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.33 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.33 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  38.33 
 
 		 177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  39.89 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  40.45 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  44.07 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  38.2 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  38.64 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.75 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  42.61 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.05 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  40.33 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.34 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  42.94 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.34 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.64 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  40.91 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  41.99 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  40.68 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.79 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.86 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  43.86 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  40.34 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  40.34 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  40.34 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  41.44 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.04 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  43.27 
 
 		 169 aa  124  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  42.61 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.88 
 
 		 175 aa  124  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.35 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  42.69 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  42.69 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  42.29 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.11 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  42.29 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  42.29 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  36.52 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.01 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  42.29 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  43.27 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>