More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3862 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 403 aa  824    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  51.88 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  48.24 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.42 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 		 802 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 374 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 801 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.52 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 376 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  31.01 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 		 379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  29.02 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  27 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 471 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  29.94 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.94 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 1101 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 495 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.55 
 
 		 927 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.07 
 
 		 1115 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 1002 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.07 
 
 		 1115 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.85 
 
 		 1119 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.35 
 
 		 872 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 		 1115 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.46 
 
 		 1115 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.35 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.35 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  26.94 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.96 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.96 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  26.5 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  26.5 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  28.1 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 752 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  28.1 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.5 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.47 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 1124 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 546 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.15 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.23 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  27.5 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  27.5 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  27.5 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 1120 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.73 
 
 		 1099 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 1154 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>