More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2588 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  31.94 
 
 
270 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 
314 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  32.1 
 
 
317 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  34.36 
 
 
334 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  30.86 
 
 
311 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  35.58 
 
 
662 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  32.47 
 
 
316 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  34.94 
 
 
313 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  34.94 
 
 
313 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  32.65 
 
 
320 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  34.78 
 
 
319 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.84 
 
 
315 aa  99  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  36.5 
 
 
309 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
359 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  36.5 
 
 
309 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  34.97 
 
 
662 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  33.09 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  30.86 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 
334 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
316 aa  96.7  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  35.66 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  32.92 
 
 
313 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 
342 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  31.06 
 
 
318 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  37.69 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  28 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 
333 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  29.87 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
322 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
313 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  29.94 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  34.36 
 
 
660 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  30.25 
 
 
334 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  33.58 
 
 
311 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
317 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  30.25 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  35.77 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  32.86 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  32.47 
 
 
336 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  30.72 
 
 
309 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  30.94 
 
 
332 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
309 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
317 aa  88.6  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  30.94 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  25.83 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
305 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3634  putative formyltransferase  31.21 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.374471  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  30.69 
 
 
336 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.53 
 
 
663 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  34.96 
 
 
316 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 
299 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 
318 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1182  formyl transferase domain protein  32.21 
 
 
328 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  33.58 
 
 
311 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  33.06 
 
 
312 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 
317 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  35.66 
 
 
314 aa  85.5  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1727  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.49 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  30.77 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1833  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.49 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  26.79 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2610  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.49 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  32.85 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  26.4 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  27.23 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  33.8 
 
 
336 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  28.4 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  38.53 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  28.3 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  28.48 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  29.32 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  28.31 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  33.06 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  30.5 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5268  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2980  putative formyltransferase  38.18 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  29.93 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  32.35 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  29.2 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3523  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2077  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.9 
 
 
660 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0065  methionyl-tRNA formyltransferase  32.3 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  28.68 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  27.85 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  27.65 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  30.14 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  30.14 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4569  formyl transferase domain-containing protein  28 
 
 
304 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  33.09 
 
 
320 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 
330 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>