More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1182 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1182  formyl transferase domain protein  100 
 
 
328 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5268  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3523  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 
316 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  31.97 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  31.97 
 
 
311 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.92 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  35.33 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  34.24 
 
 
318 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  28.17 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.46 
 
 
662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  37.63 
 
 
662 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  34.39 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2926  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.68 
 
 
672 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  32.77 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 
314 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  29.11 
 
 
312 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  28.85 
 
 
319 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  31.6 
 
 
328 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  30.5 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  30.52 
 
 
311 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  28.29 
 
 
320 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  32.07 
 
 
318 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1352  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  34.21 
 
 
673 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 
310 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2077  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.24 
 
 
660 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 
314 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  30.12 
 
 
313 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 
316 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  32.63 
 
 
318 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 
331 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  29.17 
 
 
313 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  28.96 
 
 
311 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 
314 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 
314 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 
314 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 
314 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  33.82 
 
 
319 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 
314 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 
359 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  30.19 
 
 
312 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  34.27 
 
 
320 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.4 
 
 
664 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  26.49 
 
 
310 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 
307 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  29.6 
 
 
314 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  29.6 
 
 
314 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.84 
 
 
668 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  29.15 
 
 
314 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 
310 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 
334 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  30.37 
 
 
309 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  32.52 
 
 
307 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 
310 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  29.96 
 
 
310 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 
315 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  28.67 
 
 
314 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  29.73 
 
 
332 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  29.28 
 
 
332 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1727  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.78 
 
 
667 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2610  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.78 
 
 
667 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4017  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  35.68 
 
 
660 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1833  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.78 
 
 
667 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  29.12 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  29.6 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  29.72 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 
333 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  32.3 
 
 
314 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  27.95 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  28.38 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  35.08 
 
 
311 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  28.44 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2156  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.24 
 
 
660 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  27.99 
 
 
316 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  31.78 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  30.67 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1799  putative formyltransferase  31.82 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  30.3 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  30.37 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  29.52 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  29.52 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  31.08 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  30.87 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  36.02 
 
 
663 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  24.83 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  32.61 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32 
 
 
660 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  32.42 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0924  putative formyltransferase  30.23 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.343946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  27.48 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  29.64 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  29.68 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  29.52 
 
 
310 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  33.68 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3634  putative formyltransferase  28.97 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.374471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0884  putative formyltransferase  29.1 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686111  hitchhiker  0.000000271321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  27.73 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  26.14 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>