More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1712 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 318 aa  635    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07970  methionyl-tRNA formyltransferase  60.19 
 
 		 317 aa  362  6e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.152933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  57.47 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0867  methionyl-tRNA formyltransferase  48.74 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.049042  normal  0.204791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  48.79 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  47.75 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.72 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 314 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  48.1 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.19 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  52.79 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  45.16 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.97 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  54.98 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.44 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  39.4 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  39.27 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  51.87 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  48.71 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  49.12 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  43.51 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.91 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  42.91 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  50.64 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  48.46 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>