More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2025 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  31.94 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.53 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  30.39 
 
 		 319 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1412  putative formyltransferase  34.94 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  33.54 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  32.73 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2388  putative formyltransferase  34.39 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482791  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1799  putative formyltransferase  33.76 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0924  putative formyltransferase  31.82 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.343946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  34.16 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  33.55 
 
 		 315 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.76 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.48 
 
 		 660 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  34.84 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  34.9 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  26.99 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2926  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.28 
 
 		 672 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  28.71 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  30.46 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1095  formyl transferase domain protein  29.27 
 
 		 316 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 318 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  34.81 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 		 318 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  28.1 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  31.41 
 
 		 334 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2156  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.21 
 
 		 660 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.28 
 
 		 662 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1256  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201049  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1412  putative formyltransferase  29.94 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5938  formyl transferase domain-containing protein  30.32 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723726  normal  0.313498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2239  putative formyltransferase  31.85 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1885  putative formyltransferase  29.94 
 
 		 315 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  28.9 
 
 		 318 aa  89  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5162  putative formyltransferase  29.3 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1799  putative formyltransferase  29.94 
 
 		 315 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1771  putative formyltransferase  29.94 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2277  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1392  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2403  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1154  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  32.68 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1882  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  31.36 
 
 		 359 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0015  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  30.35 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  30.33 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1195  putative formyltransferase  30.57 
 
 		 313 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  0.263795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0432  putative formyltransferase  30.57 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3634  putative formyltransferase  33.76 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.374471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  28.75 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  31.52 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1320  putative formyltransferase  31.21 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  28.92 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  29.94 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.65 
 
 		 662 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0884  putative formyltransferase  32.69 
 
 		 311 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686111  hitchhiker  0.000000271321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  29.38 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  27.38 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  31.61 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.38 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1539  formyl transferase domain protein  25.99 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6218  putative formyltransferase  29.3 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.38 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1861  putative formyltransferase  29.3 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  33.75 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  28.75 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  29.3 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  29.25 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  31.68 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  31.9 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  29.2 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  27.75 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  29.41 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  30.91 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  26.59 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3975  putative formyltransferase  28.48 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>