More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1539 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1539  formyl transferase domain protein  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  27.44 
 
 
313 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  27.44 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  26.54 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  30.32 
 
 
318 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.87 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  25.99 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  32.72 
 
 
319 aa  89  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  33.58 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 
315 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  32.09 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  29.8 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  33.58 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0945  formyl transferase domain-containing protein  32.76 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  29.71 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  30.32 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  23.01 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2077  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30 
 
 
660 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  31.76 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  31.9 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  30.57 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  30.37 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  27.97 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  32.7 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  31.01 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  29.01 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  34 
 
 
317 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.78 
 
 
315 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1412  putative formyltransferase  31.58 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  31.72 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  32.58 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  35.21 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  28.95 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  32.58 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  31.06 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  32.58 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  30.28 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  24.65 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  25.84 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  24.54 
 
 
332 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0517  formyltransferase, putative  33.08 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  30.37 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0521  putative formyltransferase  33.08 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.33 
 
 
662 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  29.85 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  24.36 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  28.57 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  27.39 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  28.93 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2550  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.1 
 
 
660 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  27.73 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0319  formyl transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  27.69 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  36.44 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  34.9 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  27.82 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  27.92 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  28.38 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  31.9 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  30.32 
 
 
359 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  32.87 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  28.29 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  28.15 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  29.85 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  28.29 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  36.44 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  36.44 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  36.44 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>