More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0366 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 336 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  92.54 
 
 		 336 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  42.18 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  40.83 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09241  putative methionyl-tRNA formyltransferase  43.07 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0403377  hitchhiker  0.00000992021 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  43.31 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09171  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.49 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.03 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.86 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.17 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  36.92 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  35.59 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  35.61 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.63 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  37.81 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  36.34 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  37.93 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  37.81 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  36.59 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.34 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.1 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  35.33 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  41.09 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.17 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.35 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  34.88 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  38.49 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  36.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  36.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  36.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  36.11 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  36.73 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  36.76 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  36.18 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.91 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  34.66 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.76 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.71 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  38.17 
 
 		 314 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.54 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.05 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 315 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  35.44 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  33.64 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>