221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1393 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
363 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  54.13 
 
 
348 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  51.73 
 
 
348 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  49.45 
 
 
361 aa  355  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 
354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  44.31 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  43.47 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  43.18 
 
 
356 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  44.31 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
344 aa  301  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 
355 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  43.15 
 
 
355 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 
355 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  43.27 
 
 
351 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  43.73 
 
 
355 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
354 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  42.7 
 
 
355 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  42.57 
 
 
355 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  45.37 
 
 
379 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  42.57 
 
 
357 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 
352 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 
350 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  42.2 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.77 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  41.31 
 
 
354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  41.53 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  38.76 
 
 
370 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  43.02 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  43.02 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  43.02 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  43.02 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  42.74 
 
 
358 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  42.74 
 
 
358 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  42.13 
 
 
358 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 
355 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  42.74 
 
 
876 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
380 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 
357 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
429 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  39.07 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 
359 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.07 
 
 
349 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 
338 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
341 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.03 
 
 
815 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 
344 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.36 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  36.84 
 
 
339 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
354 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.26 
 
 
353 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 
338 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.99 
 
 
347 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 
353 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 
344 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
338 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
353 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 
343 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.66 
 
 
343 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
352 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
348 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 
357 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  35.5 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
353 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
355 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 
356 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
343 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 
362 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
391 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
348 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
343 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
350 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 
347 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 
364 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.31 
 
 
352 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  31.89 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
359 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 
343 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 
345 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 
354 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  31.34 
 
 
388 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
344 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
343 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  34.51 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>