45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1177 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  57.62 
 
 
209 aa  254  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  45.58 
 
 
216 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  40.59 
 
 
501 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.41 
 
 
1505 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.46 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  31.43 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.97 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  24.81 
 
 
258 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  26 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  27.36 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.26 
 
 
1444 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.03 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  30.48 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  30.37 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.48 
 
 
451 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
451 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  23.19 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.91 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.03 
 
 
558 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  26.12 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.38 
 
 
259 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.37 
 
 
1145 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  26.6 
 
 
322 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  29.82 
 
 
1046 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.94 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  24.21 
 
 
321 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  23.58 
 
 
1140 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  23.68 
 
 
515 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  29.29 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  25.35 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  23.55 
 
 
1194 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 
455 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  24.71 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  23.72 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>